Ну тут все просто, чтобы не гадать, что подлежит. а что не подлежит. Заходите в технический регламент и смотрите, под какой регламент попадает та или иная продукция. В любом случае вся пищевая продукция подлежит декларированию сейчас. То есть, оформляются не сертификаты а декларации соответствия ТР ТС. За исключением рыбной продукции — на нее тех. регламент так и не вступил в действие, тут оформляются декларации соответствия ГОСТ Р.
И так, по пищевой продукции действуют следующие регламенты:
Технический регламент Таможенного Союза о безопасности пищевой продукции
Технический регламент Таможенного Союза о безопасности молока и молочной продукции
Технический регламент Таможенного союза о безопасности мяса и мясной продукции
Технический регламент Таможенного Союза на масложировую продукцию

В каждом регламенте четко расписана область применения (на что распространяется данный нормативный документ).